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transcriptome analysis
Ziel der Transkriptom-Analyse ohne vorherige Festlegung von Gruppen (unsupervised) ist es, rein aufgrund der Genexpression Gruppen zu identifizieren.
The aim of the transcriptome analysis without prior definition of groups (unsupervised) is to identify groups solely based on gene expression.
Die Transkriptom-Analyse zeigte, dass im Vergleich zu den jeweiligen Kontrollgruppen nach einer Kurzzeit-Exposition 439 Gene hochreguliert und 874 Gene runterreguliert waren, während unter Langzeit-Expositions-Bedingungen 514 Gene hochreguliert und 1206 Gene runterreguliert waren.
The transcriptome analysis showed that under short-term exposure conditions 439 genes were up-regulated and 874 genes were down-regulated in comparison to the control group, while under long-term conditions 514 genes were up-regulated and 1206 were down-regulated.
Unsere Grundlagenforschung im Labor richtet sich auf ein besseres Verständnis molekularer Mechanismen bei der Regulation von Entzündungsprozessen in einer Vielzahl von neurodegenerativen Erkrankungen. Hierzu nutzen wir unter anderem neue präklinische Mausmodelle sowie modernste wissenschaftliche Techniken wie Zwei-Photonen-Mikroskopie, Transkriptom-Analyse und induzierte pluripotente Stammzellen (iPSCs).
Our basic laboratory research aims at understanding molecular mechanisms of inflammatory regulation in a variety of neurodegenerative disease by using for example novel preclinical mouse models and state-of-the-art techniques like two-photon imaging, transcriptome analysis and induced pluripotent stem cells (iPSCs).
Mit der Entwicklung der Einzelzell-RNA-Sequenzierung wurde das Forschungsgebiet der Transkriptom-Analyse und Systembiologie revolutioniert.
With the development of single-cell RNA sequencing, the research field of transcriptome analysis and system biology has been revolutionized.
In dieser Studie führten wir eine „Einzelzelle- Transkriptom-Analyse" von Makrophagen durch, stimuliert mit einer hohen Menge FFAs, die für die Mikroumgebung des Fettgewebes bei fettleibigen Personen typisch sind.
In this study we used single-cell transcriptome analysis of macrophages, stimulated with high levels of FFAs typical for obese adipose tissue microenvironment.
Mittels eines Illumina RNA-Tiefen-Sequenz-Screenings wurde eine Transkriptom-Analyse durchgeführt.
Through illumina deep RNA sequencing a transcriptome analysis was performed.
Aus verschiedenen Anträgen wurde von den wissenschaftlichen Beratern des Verwaltungsrates das Projekt «Mikrobiom der Haut und Transkriptom-Analyse von Lymphozyten zur Untersuchung verschiedener Subpopulationen von Patienten mit atopischem Ekzem (Neurodermitis)» ausgewählt.
Out of various applications, the scientific advisers of the board of directors selected the project "Microbiome of the skin and transcriptome analysis of lymphocytes for investigation of different subpopulations of patients with atopic eczema (neurodermatitis)".
Dieses Teilproject soll das gesamte DEEP Konsortium bei der Transkriptom-Analyse unterstützen.
This subproject will provide support in transcriptome analysis for the entire DEEP consortium.
Jim Laugharn, CEO von Covaris, erläuterte: Transkriptom-Analyse wird zu einem Routineinstrument zur Bewertung des Fortschreitens einer Erkrankung.
Covaris CEO, Jim Laugharn, commented, Transcriptome analysis is becoming a routine tool for assessing disease progression.
Das Ergebniss einer Transkriptom-Analyse: Auf diesem Chip sind Arabidopsis-RNAs als Sonden aufgebracht.
Result of a transcriptome analysis: The chip contains Arabidopsis RNA probes.
Dafür wurden die gleichen Gruppen wie für die Transkriptom-Analyse gebildet, jedoch mit 60 Individuen pro Gruppe.
Während im ersten Fall nur die Sequenzinformation des jeweiligen Transkripts bekannt sein muss, so wird für die Transkriptom-Analyse die gesamte Transkriptom-Sequenzinformation benötigt.
While in the first case, only the sequence information of the transcript needs to be known in the latter the entire transcriptome sequence information is used for transcriptome analysis.
Zwei Experimente wurden durchgeführt. Im ersten Experiment wurde eine Transkriptom-Analyse durchgeführt.
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