Moderne Methoden zur Rekonstruktion von Transkriptomen
Die Gruppe nutzt Hochdurchsatz-Sequenziertechnologien, inklusive der Sequenzierung von Transkriptomen auf Einzelzellebene, um ein verbessertes Verständnis von zellulären Programmen und krankheitsrelevanten epigenetischen Markierungen zu erlangen.
The group is using large scale next generation sequencing (NGS), including single cell transcriptome sequencing, to achieve a deeper understanding of cellular programs and epigenetic disease marks.
Allerdings wurden Unterschiede zwischen den Transkriptomen von Spindel und Eizelle sowie zwischen Pb2- und Zygoten identifiziert.
However, transcriptomic differences were identified between spindle and oocyte as well as between Pb2 and zygote profiles. Translation of the abstract (German)
Für den Hauptanwendungsbereich genauso wie für das Profiling von Protein-kodierenden und nicht-Protein-kodierenden Transkriptomen, bietet die hoch entwickelte Mikrofluidik des patentierten Geniom Biochip in diesem Bereich den höchsten Grad an Automatisierung, Flexibilität Weitere Informationen zum Thema "Biotechnik"
For its main applications HybSelect - febit's innovative DNA capture method for Next-Generation-Sequencing - and protein-coding or non-coding transcriptomic profiling, the highly elaborated microfluidics of the patented Geniom Biochip offers the highest degree of automation, flexibility and efficiency throughout the field.
Außerdem führen wir Hochdurchsatzanalysen von Transkriptomen, Metabolomen und anderen „Omic-Ebenen" durch.
We also perform large scale analysis of transcriptomes, metabolomes and other omic layers.
De novo Assemblierung von Transkriptomen
Nach der Entschlüsselung der Genome verschiedenster Organismen ergeben sich aktuelle Schwerpunkte der Biochemie in der Untersuchung der Signaltransduktion, der Charakterisierung von Transkriptomen, Proteomen und des Glykomen sowie in systembiologischen Ansätzen.
Following the decoding of the genomes of all kinds of organisms, current biochemistry focuses on the investigation of signal transduction, the characterisation of transcriptomes, proteomes and glycomes, and on systems biology approaches.
Die technologischen Fortschritte sind enorm und ermöglichen die Profilierung von Genomen, Transkriptomen und Epigenomen in einer zuvor nicht möglichen Auflösung und einer beträchtlichen Anzahl von Datenpunkten, jedoch bei deutlich verringerter Qualität und einer hohen Anzahl fehlender Werte.
Technological advances are rapid and allow the profiling of genomes, transcriptomes and epigenomes at an unprecedented level of resolution, however at the cost of quality of a single observation and with a considerable number of missing values.
Sein schneller, integrierter, ergebnisorientierter Proben-zu-Ergebnis-Workflow ermöglicht die schnelle Sequenzierung von Exomen, Zielpanels und Transkriptomen in einem einzigen Lauf und bietet die Flexibilität, bei Bedarf auf Sequenzierung mit geringerem Durchsatz umzuschalten.
Its fast, integrated, sample-to-results workflow enables rapid sequencing of exomes, targeted panels, and transcriptomes in a single run, with the flexibility to switch to lower-throughput sequencing as needed.
Durch die Analyse von kompletten Transkriptomen individueller Zellen waren wir in der Lage, drei transkriptionelle Makrophagen-Zustände zu differenzieren und Gen-regulierende Bahnen, die der Identität von Makrophagen- Zuständen zugrunde liegen, zu entschlüsseln.
Analyzing full transcriptomes of individual cells, we were able to distinguish 3 macrophage transcriptional states and decipher gene regulatory pathways underlying macrophage state identity.
Sequenzier-Technologie der zweiten Generation ermöglicht nun sowohl die effiziente de novo Analyse von Genomen und Transkriptomen als auch die Re-Sequenzierung einer großen Anzahl von Individuen.
Second Generation sequencing technologies now enable the efficient de novo analysis of genomes and transcriptomes as well as the re-sequencing of a large number of individuals.
Über die Analyse von Kälteproteomen und Transkriptomen dieser Genotypen werden wir entsprechende Kandidatengene in Arabidopsis und Zuckerrübe finden und charakterisieren.
We will then analyze the cold proteome and transcriptome from these sugar beet genotypes, and select corresponding candidate genes for characterization in Arabidopsis and sugar beet.
(im BioPark seit 2006, 25 Mitarbeiter) Systembiologie von malignen und nicht-malignen Erkrankungen; Entwicklung von analytischen Werkzeugen für die high-throughput systematische Charakterisierung von Gehomen, Transkriptomen, Proteomen und Metabolomen von Zellen, Geweben und Biofluiden; Strukturelle, funktionale und vergleichende Genomik
(in the BioPark since 2006, 25 employees) Systems biology of malignant and non-malignant diseases; Development of analytical tools for the high-throughput systematic characterization of genomes, transcriptomes, proteomes and metabolomes of cells, tissues and biofluids; Structural, functional and comparative genomics
