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Graphkerne
Graph kernels are formal similarity measures that are defined directly on graphs, such as the annotated molecular structure graph, and correspond to inner products.
Graphkerne sind formale Ähnlichkeitsmaße, die inneren Produkten entsprechen und direkt auf Graphen, z.B. annotierten molekularen Strukturgraphen, definiert werden.
We first focus on the design of generic graph kernels that can be applied to graphs with or without labels.
Zuerst konzentrieren wir uns auf die Entwicklung allgemeiner Graphkerne, die auf Graphen mit oder ohne Labels angewendet werden können.
We review graph kernels, in particular those based on random walks, subgraphs, and optimal vertex assignments.
Wir geben einen Literaturüberblick über Graphkerne, insbesondere solche, die auf zufälligen Irrfahrten, Subgraphen und optimalen Knotenzuordnungen beruhen.
In the last part of this thesis, we present two examples of applications: Based on our previous contributions, we propose specialized node kernels for pixel classification in remote sensing images, and graph kernels for chemical shift prediction in structural bioinformatics.
Im letzten Teil dieser Dissertation präsentieren wir zwei Anwendungsbeispiele: Basierend auf den vorherigen Beiträgen schlagen wir spezialisierte Kerne für Pixelklassifizierung in Fernerkundungsbildern und Graphkerne für die Vorhersage von chemischen Verschiebungen in der strukturellen Bioinformatik vor.
In our experiments on benchmark graph data sets from chemoinformatics and bioinformatics, the Weisfeiler-Lehman subtree kernel gracefully scales up to large graphs, outperforms all existing graph kernels in speed, and yields highly competitive performance in graph classification.
In unseren Experimenten auf Vergleichsdatensätzen aus der Chemoinformatik und der Bioinformatik skaliert der Weisfeiler-Lehman-Unterbaumkern bis zu großen Graphen und übertrifft alle bekannten Graphkerne an Geschwindigkeit mit vergleichbarer oder bessere Vorhersagegenauigkeit bei der Graphenklassifizierung.
Third, we generalize the Weisfeiler-Lehman subtree kernel to a family of kernels that includes many known graph kernels as special cases.
Drittens verallgemeinen wir den Weisfeiler-Lehman-Unterbaumkern zu einer Kernfamilie, die viele bekannte Graphkerne als Spezialfälle beinhaltet.
The Weisfeiler-Lehman kernels we propose here now allow graph kernels to scale to large, labeled graphs.
Die Weisfeiler-Lehman-Kerne, die wir hier vorschlagen, ermöglichen es Graphkerne, auf große und gelabelte Graphen zu skalieren.
In a retrospective virtual screening study, our kernel consistently improved performance over chemical descriptors as well as other optimal assignment graph kernels.
In einer retrospektiven Studie zeigte unser Graphkern konsistent bessere Ergebnisse als chemische Deskriptoren und andere, auf optimalen Knotenzuordnungen basierende Graphkerne.
For signed graphs, I introduce new applications of the Laplacian matrix for graph drawing, spectral clustering, and describe new Laplacian graph kernels.
Für vorzeichenbehaftete Graphen führe ich neue Anwendungen der Laplace-Matrix zur Graphzeichnung, zur spektralen Clusteranalyse, und beschreibe neue Laplace-Graph-Kernel, die auf vorzeichenbehaftete Graphen angewendet werden können.
Iraklio, May 31st 2012: Uta Lösch, Stephan Bloehdorn and Achim Rettinger of Prof. Studer's research group got the Best Research Paper Award at the Extended Semantic Web Conference 2012 for their paper on "Graph Kernels for RDF Data".
Heraklion, 31.05.2012: Uta Lösch, Stephan Bloehdorn und Achim Rettinger aus der Forschungsgruppe von Prof. Studer sind für ihr Paper mit dem Titel "Graph Kernels for RDF Data" auf der Extended Semantic Web Conference 2012 mit dem Best Research Paper Award ausgezeichnet worden!
Graph kernels have attracted considerable interest in the machine learning community in the last decade as a promising solution to the above-mentioned issues.
Graphkerne haben im letzten Jahrzehnt im Bereich Maschinenlernen viel Aufmerksamkeit auf sich gezogen, da sie einen vielversprechenden Lösungsansatz für die obengenannten Probleme darstellen.
This generalization enables existing graph kernels to take into account more information about the graph topology, and thereby become more expressive.
Diese Verallgemeinerung ermöglicht es bekannten Graphkerne, mehr Informationen über die Topologie der Graphen zu berücksichtigen.
They open the door to manifold applications of graph kernels in numerous domains which deal with graphs whose size and attributes could not be handled by graph kernels before.
Sie erlauben die Nutzung von Graphkernen in zahlreichen Anwendungsgebieten, die sich mit Graphen beschäftigen, dessen Größe und Labels mit bekannten Graphkernen vorher nicht verarbeitet werden konnten.
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