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données ChIP-seq
Proper normalization between the ChIP and control samples is an essential aspect of the statistical analysis of ChIP-seq data.
Une normalisation adéquate entre les échantillons ChIP et les échantillons témoins est un aspect essentiel de l'analyse statistique des données ChIP-seq.
Here we proposed a complete pipeline for the analysis of ChIP-seq data freely available in R and composed of three R packages PICS, rGADEM and MotIV.
Nous proposons ici un ensemble complet d'analyse de données ChIP-seq disponible librement dans R et composé de trois modules PICS, rGADEM et MotIV.
In this thesis, we bring some new insights into the ChIP-Seq data analysis.
Dans cette thèse, nous apportons de nouvelles perspectives dans l'analyse des données ChIP-Seq.
Next, we propose random sampling as a powerful analytical tool in the ChIP-Seq data analysis that could be used to infer biological knowledge from the massive ChIP-Seq datasets.
Ensuite, nous proposons un nouvel échantillonnage aléatoire comme un outil puissant d'analyse des données ChIP-Seq, ce qui pourraient augmenter l'acquisition de connaissances biologiques à partir des données ChIP-Seq.
Finally, 6 new transcription factors that may be implicated in EIF4E gene regulation were predicted from the analysis of ChIP-Seq data from the encyclopedia of DNA elements (ENCODE).
Finalement, 6 nouveaux facteurs de transcription potentiellement impliqués dans la régulation du gène EIF4E ont été prédits par des analyses de données ChIP-Seq provenant de l'encyclopédie des éléments d'ADN (ENCODE).
Finally, 6 new transcription factors that may be implicated in EIF4E gene regulation were predicted from the analysis of ChIP-Seq data from the encyclopedia of DNA elements (ENCODE).
Finalement, 6 nouveaux facteurs de transcription potentiellement impliqués dans la régulation du gène EIF4E ont été prédits par des analyses de données ChIP-Seq provenant de l'encyclopédie des éléments d'ADN (ENCODE).
Bioinformatic analyses We will help you with RNA-seq and ChIP-seq data analyses until result publication.
Nous vous accompagnons dans le traitement de vos résultats RNA-seq et ChIP-seq jusqu'à la publication.
We used RNA-seq and ChIP-seq data released at the same time as the publication of the genomic reference sequence of bread wheat (IWGSC 2018).
Nous avons utilisé les données de RNA-seq et de ChIP-seq mises à disposition lors de la publication dela séquence génomique de référence du blé tendre (IWGSC 2018).
Expert in ChIP-seq data analysis, we have developed the seqMINER software to establish qualitative and quantitative correlations between multiple ChIP-seq datasets.
Expert dans le domaine de l'analyse de données de ChIP-seq, nous avons développé le logiciel seqMINER permettant d'établir des corrélations qualitatives et quantitatives entre plusieurs jeux de données de ChIP-seq.
Also, comparisons with public c-MAF CHIP-seq data confirmed a significant enrichment of c-MAF target-genes in Breg signature.
De plus, des comparaisons avec des CHIP-seq publiques de c-MAF, confirment un enrichissement significatif des cibles de c-MAF dans la signature des LBreg.
We also integrated the Tead1/4 ChIP-seq data with public data sets on Myogand Myod1 ChIP-seq and chromatin modifications to identify a series of active regulatoryelements bound by Tead factors alone or together with Myog and Myod1.
Nous avons également intégré les / 4 données Tead1 ChIP-seq avec des ensembles de données publiques sur Myog et MYOD1ChIP-Seq et chromatine modifications à identifier une série d'éléments de régulation actifsliés par des facteurs TEAD seul ou avec Myog et MYOD1.
Here we proposed a complete pipeline for the analysis of ChIP-seq data freely available in R and composed of three R packages PICS, rGADEM and MotIV.
Nous proposons ici un ensemble complet d'analyse de données ChIP-seq disponible librement dans R et composé de trois modules PICS, rGADEM et MotIV.
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