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ensemble conformationnel
The states of a conformational ensemble that are binding competent are identified, and the Gibbs energy and probability of each state and the stability constant per residue of the molecule are calculated in the presence and absence of the ligand.
On identifie les états d'un ensemble conformationnel à capacité de fixation, et on calcule l'énergie de Gibbs, la probabilité de chaque état et la constante de stabilité par résidu de cette molécule en présence et en l'absence du ligand.
computer-based strategy for peptide and protein conformational ensemble enumeration and ligand affinity analysis
stratégie informatisée pour l'énumération d'ensembles conformationnels de peptides et de protéines et l'analyse d'affinités de ligands
These methods can be grouped in two main categories: methods to construct conformational ensemble models, and methods to simulate conformational transitions.
Ces méthodes peuvent être regroupées en deux grandes catégories : les méthodes de construction de modèles d'ensembles conformationnels et les méthodes de simulation des transitions conformationnelles.
These motions give rise to a conformational ensemble of slightly different structures that interconvert with one another at equilibrium.
Ces mouvements donnent naissance à un ensemble de structures légèrement différentes les une des autres qui sont à l'équilibre en perpétuelle interconversion les unes avec les autres.
These motions give rise to a conformational ensemble of slightly different structures that interconvert with one another at equilibrium.
Ces mouvements donnent naissance à un ensemble de structures légèrement différentes les unes des autres qui sont à l'équilibre en perpétuelle interconversion les unes avec les autres.
Combining these structures with small angle X-ray scattering (SAXS) and nuclear magnetic resonance (NMR, collaboration with IBS group) data obtained for the entire protein will allow the construction of an atomic model of the phosphoprotein in the form of a conformational ensemble.
La combinaison de ces modèles cristallographiques avec des données de SAXS sur la P entière et des données de résonance magnétique nucléaire (RMN, collaboration IBS) va permettre d'obtenir un modèle atomique de la P entière sous la forme d'un ensemble de conformères.
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