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The study of transcriptomic profiles is thus essential to characterize the molecular mechanisms that govern the mycorrhizal symbiosis.
L'étude des profils transcriptomiques est donc fondamentale afin de caractériser les mécanismes moléculaires gouvernant la symbiose mycorhizienne.
That is why, firstly we focus on the issue of transcriptomic data denoising, in a visualisation framework.
C'est pourquoi, nous abordons premièrement la problématique de débruitage des données transcriptomiques.
That is why we propose to integrate other sources of information about genes, and in an active way, in the analysis of transcriptomic data.
Nous proposons donc d'intégrer d'autres sources d'information sur les gènes, de façon active, dans l'analyse des données transcriptomiques.
The third chapter focuses on modelling results of the protein translation based on the absolute quantification of transcriptomic and proteomic.
Le troisième chapitre porte sur les résultats de modélisation de la traduction protéique obtenus grâce à la quantification absolue du transcriptome et du protéome.
Overall, our studies have provided a unique framework to leverage various types of transcriptomic data in order to understand the impact of chemicals on cell biology.
Au total, nos études ont permis de fournir un cadre de travail original pour l'exploitation de différents types de données transcriptomiques pour comprendre l'impact des produits chimiques sur la biologie cellulaire.
The tools and methodologies we propose improve the quantification of transcriptomic data and lead to a better understanding of the transcriptome and of gene expression.
Les outils et les méthodologies que nous proposons améliorent la quantification des données de transcriptomique et mèneront à une meilleure compréhension du transcriptome et de l'expression des gènes.
The availability of public databases giving access to a huge amount of transcriptomic data can be thus exploited to assign putative functions to gene family members using large-scale in silico expression analyses.
La disponibilité des bases de données publiques donnant accès à une quantité énorme de données transcriptomiques peut être ainsi exploitée pour attribuer des fonctions aux membres de famille de gène à grande échelle en silico analyses d'expression.
Altogether, these data highlight the potential of transcriptomic studies to unravel but also to approach fundamental questions such as transcriptional changes occurring in a population of progenitors over time and participating to changes in their fate potential.
Ensemble, ces résultats soulignent le potentiel des études transcriptomiques à résoudre mais aussi à soulever des questions fondamentales comme les changements trancriptionnels intervenant dans une population de progéniteurs au cours du temps et participant aux changements de leur destinée.
the invention relates to a corrective method for processing the results of transcriptomic experiments obtained by differential analysis, wherein said method comprises the following steps
l'invention concerne une méthode correctrice de traitement de résultats d'expériences transcriptomiques obtenus par analyse différentielle. l'invention qui comporte les étapes suivantes
To determine it's size, I applied co-clustering algorithms to a subset of transcriptomic data, to extract it's gene signature.
Pour déterminer la taille d'une signature génique j'ai appliqué des algorithmes de co-partitionnements à un sous-ensemble de données transcriptomiques afin d'en extraire la signature génique.
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