D'analyser et de comparer la biodiversité dans des échantillons complexes (metabarcoding)
Analyze and compare levels of biodiversity in complex samples (metabarcoding).
A l'aide d'une approche intégrative, combinant cytologie, métabolomique et metabarcoding, j'ai exploré les effets des assemblages sur les holobiontes et leur environnement proche.
Using an integrative approach, combining cytology, metabolomics and metabarcoding; the effect of assemblages on holobionts and their near environment was explored.
La technologie du metabarcoding constitue à elle seule une vraie révolution.
Metabarcoding technology is a real revolution in its own right.
L'objectif de la thèse était donc de déterminer les approches bioinformatiques et statistiques les plus pertinentes pour reconstruire des réseaux d'interactions microbiennes à partir de données de metabarcoding.
The objective of the thesis was therefore to determine the most relevant bioinformatics and statistical approaches to reconstruct microbial interaction networks from metabarcoding data.
Nous avons montré comment le metabarcoding peut être utilisé en complémentarité avec les précédentes observations morphologiques pour étudier la biogéographie des protistes mixotrophes et identifier les principaux facteurs la contrôlant.
We showed how metabarcoding can be used in a complementary way with previous morphological observations to study the biogeography of mixotrophic protists and to identify key drivers of their biogeography.
L'un des défis actuels consiste à reconstruire les pathobiomes à partir de données de metabarcoding, pour identifier des agents potentiels de biocontrôle et pour surveiller en temps réel leurs réponses aux changements environnementaux.
One of the current challenges is to reconstruct pathobiomes from metabarcoding data, in order to identify potential biocontrol agents and to monitor in real time their responses to environmental changes.
La véritable force du metabarcoding réside dans l'utilisation de barcode marqueurs choisi pour une étude particulière et l'identification d'espèces ou des taxons peut être réalisé avec des marqueurs soigneusement conçu.
The real strength of metabarcoding resides in the use of barcode markers chosen for a particular study.
Grâce à la méthode de metabarcoding, les chercheurs ont pu évaluer les abondances des espèces des eukaryotes unicellulaires présentes à la surface de l'océan global, et ils les ont comparés dans les échantillons récoltés sur 121 sites différents.
Using metabarcoding, researchers were able to assess global abundances of unicellular eukaryotes present on the ocean surface, comparing data from samples collected on 121 sites.
Ces travaux suggèrent que l'utilisation en parallèle de différentes méthodologies, et notamment l'apport du metabarcoding, permet d'améliorer la connaissance sur le réseau de distribution d'eau potable et de mieux observer des changements fins, invisibles aux méthodes classiques.
Altogether, our work suggests that the use in parallel of different methodologies, particularly metabarcoding, has improved our knowledge of the bacterial communities within the Paris drinking water distribution systems and better observe subtle changes, invisible to conventional methods.
Bien que le choix de la méthode d'extraction affecte la qualité et la quantité des ADN extraits, ainsi que les abondances relatives de certaines espèces obtenues en metabarcoding, la composition de la communauté ainsi que les notes de qualités ne sont pas significativement affectées.
Although the choice of the extraction method affects the quality and the quantity of extracted DNA, as the relative abundances of some species identified with metabarcoding, the community composition and water quality index values are not significantly affected.
Ce projet est un tremplin qui servira à l'application du metabarcoding de l'ADN environnemental pour l'évaluation à grande échelle de la santé des bassins versants.
This project is a stepping stone in the application of environmental DNA metabarcoding for large-scale assessment of watershed health.
Votre lettre devrait mentionner comment votre activité de recherche peut bénéficier du DNA metabarcoding et ce que vous espérez apprendre de cette formation.
Your letter should indicate how your research will benefit from DNA metabarcoding and you are hoping to learn from this school.
Ces avantages font du metabarcoding une alternative à la méthode d'identification morphologique, intéressante dans le cadre de la DCE.
These advantages make metabarcoding an alternative method to those based on morphological identification, which is interesting for the WFD.
