Et là tu fais le sequencing.
lofreq: sensitive variant calling from sequencing data, en préparation depuis 212 jours, dernière modification il y a 199 jours.
lofreq: sensitive variant calling from sequencing data, 214 days in preparation, last activity 201 days ago.
Les nouvelles techniques de séquençage (next generation sequencing) permettent d'explorer la diversité (= le polymorphisme) de ces gènes à un niveau de complexité très largement supérieur.
The advent of new technologies (next generation sequencing) allows exploring the diversity (i.e. the polymorphism) of these genes with a degree of complexity and precision never attained before.
Notre approche diffère de l'existant par plusieurs aspects notamment dans l'utilisation modifiée d'une méthode existante (le "de novo sequencing") mais aussi par nos méthodes d'évaluation des protéines (comparaison au niveau des spectres).
Our approach differs from the existing literature by several aspects: the use of a modified classical method ("de novo sequencing") and a different evaluation function (spectra comparisons).
Ce modèle d'identification a permis ensuite de proposer et de valider une modélisation pour le problème de "de novo protein sequencing" qui consiste à retrouver la séquence d'une protéine à partir seulement des données expérimentales.
From this model, an approach for the "de novo protein sequencing" problem has been proposed and validated.
La diversité microbienne sera étudiée par 'high-throughput sequencing' (séquençage d'amplicons et métagénomique), culture et microscopie.
Microbial biodiversity of the different habitats will be studied using high throughput sequencing (amplicon sequencing and metagenomics), culturing and microscopy.
Cette approche utilise des données transcriptomiques générées par RNA sequencing et confronte les résultats avec ceux obtenus dans d'autres tissus abdominaux pouvant potentiellement interférer avec l'imagerie des cellules tels que l'estomac, le foie ou les intestins.
This approach uses transcriptomic data generated by RNA sequencing and compares the results with those obtained from other abdominal tissues that could potentially interfere with cell imaging, such as the stomach, liver or intestines.
La mise au point de techniques d'analyse dites WGS (whole-genome sequencing) a également permis d'identifier des mutations apparaissant de novo, c'est à dire non héritées depuis les parents.
The development of WGS (whole-genome sequencing) analysis techniques has also made it possible to identify mutations appearing de novo, i.e. not inherited from the parents.
Les techniques de détection moléculaire automatisées, multiplex PCR et next generation sequencing (NGS) seront ici très importantes à côté de la vigilance de tous les acteurs sur le terrain et de l'application de nouvelles idées en matière de biosécurité.
Automated molecular detection, multiplex PCR and next generation sequencing (NGS) techniques will play a very important role, alongside vigilance by all field FFBO's and the application of new biosafety concepts.
Nous avons étudié les racines colonisées de 40 sujets, par séquençage CDS (culture-dependent sequencing) et analyse ARISA (automated ribosomal intergenic spacer analysis).
The colonized roots from 40 individuals were examined using culture-dependent sequencing and ARISA (automated ribosomal intergenic spacer analysis).
Le NGS et le séquençage du génome entier (WGS pour whole-genome sequencing) sont devenus des outils précieux dans la lutte contre les maladies infectieuses.
Next-generation sequencing (NGS) and whole-genome sequencing (WGS) have become powerful tools in the fight against infectious diseases.
Les approches expérimentales que nous utilisons incluent le séquençage des exomes et du transcriptome complet (RNA-seq) par next-generation sequencing ainsi que la chémogénomique.
We use experimental approaches including whole exome and transcriptome (RNA-seq) sequencing by next-generation sequencing and chemogenomics.
Ces modèles servent également à des analyses globales et bioinformatiques en combinant "deep RNA/DNA sequencing" et des données "omiques" pré-existantes (methylome, miRome, transcriptome, anomalies génétiques) visant l'identification sans a priori de marqueurs pronostiques ou de cibles thérapeutiques.
These models serve also for global and bioinformatics analyses by combining "deep RNA/DNA sequencing" and pre-existing "omics" data (methylome, miRome, transcriptome, genetic anomalies) aiming at the identification without a priori of prognostic markers and therapeutic targets.
