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codon usage
Chaque espèce vivante a une préférence d'usage des codons.
Each living species has a different preference for codon usage.
Ce phénomène est appelé le biais de l'usage des codons et est spécifique de l'espèce.
This phenomenon is called the codon usage bias and is species specific.
Le génome affiche un contenu génique, une composition nucléotidique et un usage des codons typiques des génomes mitochondriaux chez les métazoaires.
The genome contains the gene content, base composition, and codon usage typical of metazoan mitochondrial genomes.
Les séquences de la sonde ou de l'amorce sont déterminées par référence au biais d'usage des codons d'un acide nucléique cible.
Probe or primer sequences are determined by reference to codon usage bias of a target nucleic acid.
Chacun de ces deux comportements peut être relié à un phénomène de régulation cellulaire en réponse au stress : un changement au niveau de la wobble base pourrait être un moyen de réguler la traduction en modifiant l'usage des codons.
Change at the tRNA wobble base (position 34) could be a way to regulate translation by modifying the codon usage.
Nous avons aussi montré que les modèles incorporant l'hypermutabilité des transitions en contexte CpG prédisent un usage des codons plus proche de celui des gènes étudiés.
We have also shown that models incorporating hypermutability of transitions in CpG contexts predict a codon usage closer to that of the genes studied.
Leur origine exogène est notamment illustrée par un contenu en guanine et cytosine (GC% ou coefficient de Chargaff) et un usage des codons différents de ceux du chromosome ainsi que par la présence de gènes impliqués dans la mobilisation de l'ADN.
The islands' foreign origin is supported by a codon usage and guanosine (G) and cytosine (C) content which often differ from the host's chromosomal core, as well by as the presence of a range of mobility genes involved in DNA transmission.
Une analyse de l'usage des codons a montré un biais en faveur des codons se terminant avec un A/T.
Codon usage analysis showed a bias towards A/T ending codons.
Objet de la recherche Étudier le mode d'évolution du génome à l'aide d'outils de bioinformatique, plus particulièrement en ce qui concerne l'usage des codons, la duplication des gènes et la recombinaison génétique.
Research involves Studying the patterns of genome evolution using bioinformatics tools, with special attention to codon usage, gene duplication, and the evolution of genetic recombination.
Ce système s'est avéré inapproprié pour l'étude du transporteur Rv1747, à cause vraisemblablement des différences entre E. coli et M. tuberculosis dans l'usage des codons.
This system has proved not to be useful for the study of Rv1747, due probably to codon usage differences between E. coli and M. tuberculosis.
Ces résultats donnent à penser que tant la sélection naturelle que le biais mutationnel ont contribué au biais dans l'usage du code, la sélection étant la principale force à moduler l'usage des codons dans ces génomes cp d'Asteraceae.
These findings suggested that both natural selection and mutational bias contributed to codon bias, while selection was the major force to shape the codon usage in these Asteraceae cp genomes.
AMIMat permet de construire k matrices de transition à partir de k classes de gènes définies selon l'usage des codons synonymes.
AMIMat allows construction of k transition matrices from k gene classes defined according to synonymous codon usage.
En particulier, l'hypermutabilité des transitions du contexte CpG peut à elle seule expliquer la sélection détectée par Yang and Nielsen sur l'usage des codons.
In particular, the hypermutability of transitions in the CpG context alone can explain the selection on codon usage detected by Yang and Nielsen.
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