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sequence alignment
Es generiert eine Sammlung von paarweisen Alignments, die das Multiple Sequenzalignment führen.
It generates a library of pairwise alignments to guide the multiple sequence alignment.
Das Sequenzalignment wird in einem Fenster angezeigt.
Nach dem erfolgreichen Teilnahme an diesem Modul verfügen sie über Grundkenntnisse in den Bereichen Dynamisches Programmieren, Sequenzalignment, Rekonstruktion phylogenetischer Bäume und haben einen Einblick in grundlegende Ansätze der bioinformatischen Analyse von Molekülstrukturen.
After passing the module they have elementary knowledge in dynamic programming, sequence alignment, reconstruction of phylogenetic trees and have gain insight into fundamental bioinformatic approaches to analysis the structure of molecules.
Optionen zur effizienten Ansicht sehr großer Bilder, die rasche Umwandlung von Bildern und Gitternetzregionen, Sequenzalignment und Ähnlichkeitsanalyse und viele andere Funktionalitäten verbessern den Workflow von Anwendungen in Forschung und Entwicklung, computergestützter Fotografie, Arbeiten mit dem Mikroskop, etc.
Efficient viewing of very large images, fast conversions of images to mesh regions, sequence alignment and similarity analysis, and a lot more improve the workflow of applications in research and development, computational photography, microscopy, and more.
Die Qualität einer Konservierungsanalyse hängt maßgeblich von einem korrekten multiplen Sequenzalignment ab.
The quality of such a conservation analysis depends critically on a correct multiple sequence alignment.
Der Hirschberg-Algorithmus ist ein allgemein einsetzbarer und optimaler Algorithmus zum Auffinden eines Sequenzalignment.
Hirschberg's algorithm is a generally applicable algorithm for optimal sequence alignment.
Zu diesem Zweck wurde ebenfalls ein strukturbasiertes multiples Sequenzalignment herangezogen, das es erlaubt die Aminosäureverteilung an verschiedenen Positionen des Enzyms in einer riesigen Anzahl strukturell verwandter Enzyme zu bestimmen.
Again, there was applied an structure-based multiple sequence alignment that allows the determination of the amino acid distribution on certain enzyme position within a huge number of structurally related enzymes.
Dieser wurde umfassend modifiziert unter Bezugnahme auf andere Alignment- und Baumerstellungsmethoden (Hmmalign- und Parsimonie-Baum) sowie umfassendes, paarweises Sequenzalignment von Kinasedomänen.
This was extensively modified by reference to other alignment and tree building methods (hmmalign and parsimony trees), and extensive pairwise sequence alignment of kinase domains.
Wir untersuchen Spingläser, Zufallsfeldsysteme, das Knotenüberdeckungsproblem, das Erfüllbarkeitsproblem, Perkolationssysteme, RNA Sekundärstrukturen, Sequenzalignment und Extremwertverteilungen.
We work on spin glasses, random-field systems, the vertex-cover problem, the satisfiability problem, percolation problems, RNA secondary structures, sequence alignment and large-deviation properties.
Sequenzalignment von DNS ist die Grundlage des mikrobiologischen Nutzens von phylogenetischen Stammbäumen.
Sequence Alignment of DNA sequences is prerequisite for the microbiologic usage of phylogenetic trees.
Mit einem multiplen Sequenzalignment als Eingabe baut HMMER ein statistisches Modell, genannt Hidden-Markov-Modell. Mit diesem kann in Sequenzdatenbanken nach homologen Sequenzen gesucht werden. Dabei können gleichzeitig, der gesuchten Proteinfamilie zugehörige, Sequenzen alignt werden.
Given a multiple sequence alignment as input, HMMER builds a statistical model called a "hidden Markov model" which can then be used as a query into a sequence database to find (and/or align) additional homologues of the sequence family.
Diese Arbeit konzentriert sich auf das Sequenzalignment durch Ausführen des am meisten bekannten Algorithmus, dem Needleman-Wunsch Algorithmus.
Kooperationspartner -> This thesis is currently focused on sequence alignment by executing the most popular algorithm, the Needleman-Wunsch algorithm.
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