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Ce projet est un tremplin qui servira à l'application du metabarcoding de l'ADN environnemental pour l'évaluation à grande échelle de la santé des bassins versants.
This project is a stepping stone in the application of environmental DNA metabarcoding for large-scale assessment of watershed health.
Le metabarcoding de zooplancton d'une série chronologique de deux ans a confirmé la présence d'ENI en phase larvaire, et leur reproduction.
Zooplankton metabarcoding of a two-year time series confirmed the presence of NIS at the larval stage, and thus their reproduction.
Durant son stage Marjorie a exploité un jeu de données de metabarcoding de méroplancton côtier afin d'une part d'évaluer la fiabilité de cette technique sur ce type d'échantillon et d'accéder à la compréhension des changements de structure (diversité, composition) de cette communauté.
During her internship, Marjorie exploited a data set of metabarcoding of coastal meroplacton in order to evaluate the reliability of this technique on this type of sample and to gain an understanding of the changes in structure (diversity, composition) of this community.
Le metabarcoding de cet ADN environnemental (ADNe) consiste à le collecter, l'amplifier et le séquencer pour identifier les espèces présentes grâce à des bases de séquences génétiques de référence.
The metabarcoding of this environmental DNA (eDNA) consists in collecting this DNA, amplifying and sequencing it to identify the species present using a genetic reference database.
Des technologies variées seront mise au service de cet objectif (bio-senseurs, suivi moléculaire, détection immunologique, imagerie hyperspectrale, analyse metabarcoding de la flore associée).
Diversified technologies will be tested in this respect (biosensors, molecular patterns, immuno-detection, hyperspectral imaging, metabarcoding of associated flora).
Metabarcoding de l'ADN environnemental: des données brutes à la RDA par Alexis Carteron et Simon Morvan
eDNA metabarcoding: From raw data to RDA by Alexis Carteron and Simon Morvan
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