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Biopython
Los archivos de secuencias de gran tamaño pueden exceder los límites de recursos memoria de un ordenador, así que Biopython ofrece varias opciones para acceder a los registros de grandes archivos.
Very large sequence files can exceed a computer's memory resources, so Biopython provides various options for accessing records in large files.
El desarrollo de Biopython comenzó en 1999 y su primera versión fue publicada en julio de 2000.
Biopython development began in 1999 and it was first released in July 2000.
Siempre que es posible, en las aplicaciones Biopython se usa el lenguaje de programación Python, de manera que sea más fácil de utilizar para los usuarios de este lenguaje.
Wherever possible, Biopython follows the conventions used by the Python programming language to make it easier for users familiar with Python.
Cuando lee archivos, la información descriptiva del archivo puede ser utilizada para completar los miembros de las clases Biopython, tales como SeqRecord.
When reading files, descriptive information in the file is used to populate the members of Biopython classes, such as SeqRecord.
Biopython: Los módulos más importante explicados con ejemplos de uso.
Biopython: Most important Biopython modules explained with sample usage.
Competidor: BioPerl, BioJava y BioPython requieren una extensa programación para crear prototipos de aplicaciones interactivas
Competitor note: BioPerl, BioJava, and BioPython require extensive programming to prototype interactive applications
SeqIO.write(genome, genome.id +'.fasta', 'fasta') Gracias al módulo Bio.Entrez, los usuarios de Biopython pueden descargar datos biológicos a partir de las bases de datos NCBI.
SeqIO.write(genome, genome.id +'.fasta', 'fasta') Through the Bio.Entrez module, users of Biopython can download biological data from NCBI databases.
BioPython y manejo de secuencias genómicas y proteínas, expositores: Dr. Javier Sánchez Galán y Dra. Oriana Batista.
BioPython and management of genomic sequences and proteins, speakers: Dr. Javier Sánchez Galán and Dr. Oriana Batista.
Tutorial y manual de Biopython (en inglés) (PDF) Código fuente de Biopython en GitHub.
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