Examples with "Contigs assembliert" and their translation in Engels
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Da repetitive Elemente ein großes Hindernis für die erfolgreiche Assemblierung von Pflanzengenomsequenzen sind und häufig große Lücken in Genomsequenzen oder falsch assemblierte Contigs verursachen, habe ich zusätzlich eine genomische „Shotgun"-Klonbank mit kleinen Insert hergestellt.
Since repeats are a major obstacle for successful assembly of plant genome sequences, frequently causing gaps and misassembled contigs, I generated a genomic short-insert library.
Mit dem Newbler-Assembler wurden 206.726 dieser 454-Reads zusammen mit 13.131 der Sanger-Reads der Plasmid-Bibliothek zu 69 Contigs>500 bp assembliert. Von diesen konnten 45 am Referenzstamm E. faecalis V583 ausgerichtet werden.
Using the Newbler assembler an assembly of 69 contigs>500 bp was created by including 206,726 of said 454-reads and 13,131 of the Sanger-reads of the forementioned plasmid-library Of those contigs, 45 could be mapped to the reference strain E. faecalis V583.
Nach den Alignments liegen multiple Konsensus-Sequenzen aller assemblierten Sequenzen vor, die die Contigs eines Genoms oder der Assemblierung darstellen.
After the alignment step, multiple consensus sequences of all aligned or assembled reads are obtained which represent the contig sequences of a given genome or assembly.
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