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The most likely reason for this is that standard RNA-seq analysis focuses only on known transcripts, thus ignoring transcription outside of annotated genes.
Der wahrscheinlichste Grund dafür ist, dass standardmäßige RNA-seq-Analysen sich meist nur auf bekannte Transkripte begrenzen und somit Transkription außerhalb von annotierten Genen ignorieren.
Our recent tissue dual RNA-Seq analysis of Y. pseudotuberculosis residing within the lymphatic tissue of mice revealed the entire repertoire of genes, which are transcribed during infection.
Mittels einer kürzlich durchgeführten Tissue dual RNA-Seq Analyse von Y. pseudotuberculosis im lymphatischen Gewebe konnten wir das gesamte Repertoire der während der Infektion exprimierten Gene sichtbar machen.
GenePattern is a powerful genomic analysis platform that provides access to hundreds of tools for gene expression analysis, proteomics, SNP analysis, flow cytometry, RNA-seq analysis, and common data processing tasks.
GenePattern ist eine leistungsstarke genomische Analyse-Plattform, die Zugriff auf Hunderte von Werkzeugen für die Genexpressionsanalyse, Proteomics, SNP-Analyse, Durchflusszytometrie, RNA-seq-Analyse und für gängige Datenverarbeitungsaufgaben zur Verfügung stellt.
Analysis of the differential gene expression patterns by RNA-seq analysis revealed that many of the genes up-regulated by the 'active plant' are mainly down-regulated in the mutant.
Moreover, RNAi-based knockdown of the factors and subsequent RNA-seq analysis was performed in Drosophila S2 cells to more directly study the effects of CHD1, DOM and Elp3 on gene regulation.
Um die Auswirkung von CHD1, DOM und Elp3 auf die Genexpression in einer direkteren Art und Weise analysieren zu können führten wir einen auf RNAi-basierenden knock-down der drei Faktoren mit anschließender RNA-Seq Analyse in S2 Zellen durch.
The results are shown from RNA-Seq analysis page...
Unlike other RNA-Seq analysis methods, it does not exclude ambiguously mapping reads, but rather explicitly includes all mappings to perform a more comprehensive prediction.
Im Gegensatz zu anderen Methoden zur Analyse von RNA-Sequenzierungsdaten entfernt GIIRA dabei nicht die mehrdeutig alignierten Sequenzen, sondern verwendet stattdessen explizit alle Alignments um eine umfassendere Vorhersage treffen zu können.
Research focuses on RNA-Seq analysis, to develop best practices and user-friendly workflows for processing and integrating gene expression data as well as to provide assistance for experiment design, analysis and interpretation.
Ziel des Projektes ist es, benutzerfreundliche Arbeitsabläufe zur Analyse und Integration von Genexpressionsdaten zu entwickeln und praktische Hilfestellung bei der Auswertung von RNA-Sequenzierungsexperimenten zu geben.
Data analysis mostly starts with usage of open-source software (eg. Tuxedo Suite for RNA-seq analysis). Software choices are primarily done taking into account the biological questions pursued by the researcher, previous record of publications, and respective users community.
Die Datenanalyse beginnt meist mit der Anwendung von Open-Source-Software (zum Beispiel Tuxedo Suite für die RNA-Sequenzanalyse). Die Wahl der Software erfolgt hauptsächlich unter Einbeziehung der biologischen Fragestellungen, denen der Forscher nachgeht, der Dokumentation früherer Publikationen und der entsprechenden Nutzergemeinschaft.
Affymetrix ATH1 arrays and Tiling arrays, together with RNA-Seq analysis, confirmed genome-wide alterations of the prl1 mutant.
Affymetrix ATH1-Arrays und Tiling-Arrays bestätigten zusammen mit der RNA-Seq-Analyse die im gesamten Genom vorhandenen Veränderungen der prl1 Mutante.
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