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De plus, notre couche de communication multi-threadée réduit le temps d'exécution dans le cas où plusieurs threads OpenMP participent simultanément aux communications MPI.
Moreover, we show a performance improvement with our multi-threaded communication layer where the OpenMP threads concurrently participate to the MPI communications
Avec un grand nombre de nœuds, il peut s'avérer bénéfique d'utiliser encore plus de threads OpenMP par rang MPI afin de réduire la quantité de communications requises.
With large number of nodes it might be beneficial to use more OpenMP threads per MPI rank to reduce the amount of required communication.
Sur cette version, il est également possible de contrôler le nombre de threads OpenMP avec l'option de ligne de commande"-ntomp" et le nombre de rangs MPI avec l'option"-ntmpi".
For this version the number of OpenMP threads can be also controlled with the command line option-ntomp and the number of MPI ranks can be controlled with-ntmpi.
Il convient de définir correctement l'allocation des threads OpenMP et des process MPI pour les cœurs du système.
GROMACS OpenMP thread and MPI processes should be pinned correctly to the cores/threads of the system.
Notre première contribution permet de réduire le surcoût des supports exécutifs OpenMP en optimisant le travail d'activation et de synchronisation des threads OpenMP pour les codes MPI+OpenMP.
Our first contribution reduces the overhead of the OpenMP layer by optimizing the creation and synchronization of threads for MPI+OpenMP codes.
Notre contribution a pourbut d'optimiser l'opération MPI Allreduce en réutilisant des unités de calcul inoccupées, et faisant intervenirdes threads OpenMP.
Our contributionconsists in proposing a technique to exploit idle cores in order to help the operation, with theexample of MPI Allreduce collective.
Nous introduisons également le concept de collectives unifiées, impliquantdes tâches MPI et des threads OpenMP dans une même opération.
We also introduce unified Collectives involving both MPI tasks andOpenMP threads.
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